Saarioinen Oy:n tuotantolaitoksilla ei ole erillisiä jätevedenpuhdistusyksikköjä vaan jätevedet johdetaan esikäsittelyn, esimerkiksi välppäyksen tai rasvanerotuksen, jälkeen kunnallisille jätevedenpuhdistamoille. Syntyvä jätevesi ei sisällä ongelmajätteitä vaan lähinnä orgaanista kiintoainesta jota kunnallisten jätevedenpuhdistamoiden prosessit poistavat nykyään erittäin tehokkaasti.
Jätevesikuormitusta seurataan sekä kokonaiskuormituksen että tuotantomäärään suhteutetun kuormituksen avulla. Jätevesikuormituksen päämittarina käytetään biologista hapenkulutusta (BHK7), joka kuvaa jäteveden aiheuttamaa orgaanista kuormitusta. Kuormitus saadaan selville ottamalla jätevesistä säännöllisesti näytteitä ennen niiden johtamista kunnallisille jätevedenpuhdistamoille.
Kiintoaineen vähentäminen jätevedestä vaikuttaa suoraan jätevesikuormituksen määrään ja kiintoaineen poistamiseksi jätevedestä tehdään monenlaisia toimenpiteitä. Yksi tärkeimmistä toimenpiteistä on oman ja puhtaanapidosta vastaavien yritysten henkilökunnan kouluttaminen oikeisiin työtapoihin. Hyviin työtapoihin kuuluu mm. kiintoaineen poistaminen pinnoilta esimerkiksi lastan tai kiintoaineimurin avulla ennen pesun aloittamista.
Jäteveden kokonaiskuormitus kasvoi vuonna 2009 60 tonnia vuoden 2008 tasosta mutta ominaiskulutus pysyi lähes vuoden 2008 tasolla.
